《火影忍者》是由岸本齐史创作的日本漫画作品，有三部动画改编作品。根据题目所提的“三代火影忍者大结局”，可以推测指的是第一部动画改编作品的结局。
第一部动画改编作品《火影忍者》是由2002年至2007年间播出的，剧情围绕着主人公漩涡鸣人，以及他的搭档——宇智波佐助、春野樱，以及他们同班的忍者朋友们展开。故事讲述了他们成长为优秀忍者的经历，以及对抗邪恶势力的斗争。
在第一部动画的最后，佐助为了实现自己复仇的目标离开了村子，成为了叛忍。而鸣人则努力追寻佐助并试图拯救他。最终，两人在“火之国忍者大战”中再次相遇，展开了一场决定两人命运的战斗。佐助原本计划借助奥义“须佐能乎”的力量来打败鸣人，但在战斗过程中，他得知了真相——他的哥哥宇智波鼬牺牲了自己，以保护佐助。
了解到真相后，佐助对自己的途径与行为产生了疑问，并开始重新审视自己的选择。最终，佐助选择了与鸣人合作，共同对抗追捕他们的忍者。两人消除了彼此之间的误解，最后彼此承认对方的强大。整个故事以佐助选择回归村子，与鸣人成为“忍者联合”的朋友为结局。
需要注意的是，《火影忍者》有几部不同的动画改编作品，每一部的结局略有差异，上述结局为第一部动画的结局。
